Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp3P28862 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp3P28862 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp3P28862 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms