Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Aco1P28271 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aco1P28271 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aco1P28271 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aco1P28271 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Aco1P28271 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aco1P28271 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aco1P28271 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Aco1P28271 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aco1P28271 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aco1P28271 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms