Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja8P28236 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja8P28236 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja8P28236 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gja8P28236 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gja8P28236 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja8P28236 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gja8P28236 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja8P28236 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja8P28236 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja8P28236 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja8P28236 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gja8P28236 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms