Protein–RNA interactions for Protein: P27808

Mgat1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat1P27808 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mgat1P27808 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mgat1P27808 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mgat1P27808 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms