Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6aP27664 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pde6aP27664 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pde6aP27664 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms