Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xrcc5P27641 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrcc5P27641 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms