Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lmo2P25801 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmo2P25801 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmo2P25801 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmo2P25801 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmo2P25801 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmo2P25801 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmo2P25801 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmo2P25801 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmo2P25801 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmo2P25801 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmo2P25801 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmo2P25801 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmo2P25801 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmo2P25801 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmo2P25801 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmo2P25801 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms