Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pax3P24610 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pax3P24610 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pax3P24610 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pax3P24610 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pax3P24610 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pax3P24610 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pax3P24610 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pax3P24610 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pax3P24610 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pax3P24610 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pax3P24610 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pax3P24610 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pax3P24610 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pax3P24610 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pax3P24610 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pax3P24610 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pax3P24610 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pax3P24610 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pax3P24610 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pax3P24610 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pax3P24610 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pax3P24610 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pax3P24610 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pax3P24610 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pax3P24610 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pax3P24610 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1261.6 ms