Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou5f1P20263 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou5f1P20263 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms