Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a1P19437 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a1P19437 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms