Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18530 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18530 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18530 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18530 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18530 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18530 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18530 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18530 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18530 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18530 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18530 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18530 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P18530 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18530 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18530 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18530 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18530 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P18530 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18530 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18530 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18530 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18530 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18530 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18530 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18530 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P18530 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P18530 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P18530 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P18530 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P18530 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P18530 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P18530 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P18530 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18530 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18530 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P18530 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18530 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18530 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18530 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P18530 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18530 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18530 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18530 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18530 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18530 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18530 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18530 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18530 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18530 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18530 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18530 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18530 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18530 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18530 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18530 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18530 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18530 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18530 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18530 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18530 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18530 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18530 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18530 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18530 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18530 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18530 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18530 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18530 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18530 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18530 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18530 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P18530 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18530 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18530 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18530 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18530 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18530 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P18530 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18530 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18530 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18530 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18530 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18530 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18530 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P18530 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P18530 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P18530 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18530 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18530 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18530 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18530 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18530 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18530 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18530 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18530 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18530 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18530 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18530 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P18530 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms