Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P18524 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P18524 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P18524 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
P18524 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P18524 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
P18524 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
P18524 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
P18524 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
P18524 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
P18524 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P18524 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P18524 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P18524 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P18524 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P18524 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
P18524 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P18524 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P18524 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P18524 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P18524 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
P18524 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P18524 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P18524 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P18524 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P18524 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P18524 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
P18524 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P18524 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P18524 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P18524 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P18524 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P18524 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P18524 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P18524 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P18524 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P18524 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P18524 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P18524 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P18524 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P18524 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P18524 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P18524 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P18524 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P18524 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P18524 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P18524 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P18524 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P18524 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P18524 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P18524 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P18524 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P18524 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P18524 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P18524 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P18524 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P18524 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P18524 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P18524 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P18524 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P18524 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P18524 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
P18524 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P18524 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P18524 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P18524 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P18524 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P18524 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P18524 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P18524 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P18524 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P18524 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P18524 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P18524 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P18524 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P18524 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P18524 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P18524 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P18524 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P18524 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P18524 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P18524 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P18524 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P18524 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P18524 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P18524 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P18524 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P18524 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P18524 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P18524 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P18524 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
P18524 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
P18524 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P18524 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
P18524 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P18524 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P18524 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P18524 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P18524 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P18524 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms