Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Selenbp1P17563 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Selenbp1P17563 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Selenbp1P17563 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms