Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd2P13011 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd2P13011 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd2P13011 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd2P13011 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd2P13011 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd2P13011 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scd2P13011 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms