Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn1P12960 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cntn1P12960 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn1P12960 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms