Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr4a1P12813 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nr4a1P12813 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms