Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd8bP10300 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.2 ms