Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UbbP0CG49 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms