Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifna9P09235 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna9P09235 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms