Protein–RNA interactions for Protein: P08884

Gzme, Granzyme E, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmeP08884 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GzmeP08884 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GzmeP08884 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GzmeP08884 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GzmeP08884 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GzmeP08884 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GzmeP08884 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GzmeP08884 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GzmeP08884 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GzmeP08884 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GzmeP08884 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GzmeP08884 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GzmeP08884 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GzmeP08884 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GzmeP08884 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GzmeP08884 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GzmeP08884 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GzmeP08884 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms