Protein–RNA interactions for Protein: P06799

Ifna7, Interferon alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna7P06799 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifna7P06799 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifna7P06799 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna7P06799 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna7P06799 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna7P06799 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna7P06799 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna7P06799 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna7P06799 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna7P06799 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna7P06799 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna7P06799 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna7P06799 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna7P06799 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna7P06799 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms