Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb1bP06795 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Abcb1bP06795 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms