Protein–RNA interactions for Protein: P04344

Crygb, Gamma-crystallin B, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygbP04344 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CrygbP04344 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygbP04344 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygbP04344 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygbP04344 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygbP04344 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygbP04344 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygbP04344 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygbP04344 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygbP04344 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygbP04344 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygbP04344 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms