Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GzmbP04187 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GzmbP04187 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GzmbP04187 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GzmbP04187 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GzmbP04187 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GzmbP04187 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms