Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxa7P02830 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxa7P02830 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxa7P02830 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms