Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Ab1P01921 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms