Protein–RNA interactions for Protein: P01786

Ig heavy chain V region MOPC 47A, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01786 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01786 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01786 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01786 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01786 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01786 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01786 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01786 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01786 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01786 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01786 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01786 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01786 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01786 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01786 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01786 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01786 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01786 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01786 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01786 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01786 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01786 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01786 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01786 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01786 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01786 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01786 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01786 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01786 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01786 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01786 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01786 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01786 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01786 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01786 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01786 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01786 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01786 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01786 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01786 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01786 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01786 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01786 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01786 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01786 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01786 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01786 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01786 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01786 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01786 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01786 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01786 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01786 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01786 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01786 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01786 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01786 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01786 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01786 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01786 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01786 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01786 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01786 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01786 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01786 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01786 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01786 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01786 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01786 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01786 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01786 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01786 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01786 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01786 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01786 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01786 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01786 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01786 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01786 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01786 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01786 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01786 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01786 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01786 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01786 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01786 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01786 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01786 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01786 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01786 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01786 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01786 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01786 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01786 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01786 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01786 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01786 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01786 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01786 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01786 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms