Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01727 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01727 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01727 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01727 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01727 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01727 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01727 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01727 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01727 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01727 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01727 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01727 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01727 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01727 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01727 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01727 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01727 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01727 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01727 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01727 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01727 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01727 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01727 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01727 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01727 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01727 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01727 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01727 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01727 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01727 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01727 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01727 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01727 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01727 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01727 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01727 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01727 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01727 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01727 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01727 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01727 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01727 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01727 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01727 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01727 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01727 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01727 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01727 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01727 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01727 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01727 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01727 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01727 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01727 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01727 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01727 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01727 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01727 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01727 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01727 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01727 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01727 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01727 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01727 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01727 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01727 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01727 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01727 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01727 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01727 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01727 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01727 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01727 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01727 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01727 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01727 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01727 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01727 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01727 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01727 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01727 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01727 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01727 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01727 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms