Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01641 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01641 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01641 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01641 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01641 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01641 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01641 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01641 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01641 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01641 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
P01641 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01641 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01641 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01641 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01641 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
P01641 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01641 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01641 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01641 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01641 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
P01641 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01641 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01641 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01641 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01641 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01641 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01641 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01641 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01641 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01641 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01641 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01641 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01641 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01641 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01641 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01641 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01641 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01641 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01641 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01641 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01641 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01641 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01641 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01641 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01641 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01641 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01641 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01641 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01641 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01641 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01641 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
P01641 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01641 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01641 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01641 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01641 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01641 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01641 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01641 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01641 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01641 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01641 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
P01641 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01641 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01641 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01641 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01641 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01641 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01641 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01641 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01641 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01641 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01641 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01641 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01641 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01641 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01641 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01641 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01641 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01641 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01641 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01641 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01641 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01641 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01641 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01641 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01641 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01641 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01641 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01641 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01641 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
P01641 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
P01641 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01641 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01641 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01641 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01641 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01641 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01641 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms