Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Serf1O88892 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serf1O88892 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serf1O88892 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serf1O88892 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Serf1O88892 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serf1O88892 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serf1O88892 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serf1O88892 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serf1O88892 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms