Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AurkcO88445 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AurkcO88445 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AurkcO88445 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AurkcO88445 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AurkcO88445 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AurkcO88445 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AurkcO88445 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkcO88445 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkcO88445 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms