Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smpd2O70572 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd2O70572 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd2O70572 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms