Protein–RNA interactions for Protein: O70343

Ppargc1a, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1aO70343 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1aO70343 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppargc1aO70343 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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