Protein–RNA interactions for Protein: O70338

Rnaseh1, Ribonuclease H1, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh1O70338 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnaseh1O70338 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnaseh1O70338 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnaseh1O70338 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms