Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngr1O55100 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngr1O55100 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syngr1O55100 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms