Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn20O55082 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptpn20O55082 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptpn20O55082 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms