Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NlkO54949 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NlkO54949 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NlkO54949 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NlkO54949 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NlkO54949 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NlkO54949 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NlkO54949 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NlkO54949 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NlkO54949 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NlkO54949 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NlkO54949 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NlkO54949 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NlkO54949 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NlkO54949 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NlkO54949 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NlkO54949 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NlkO54949 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NlkO54949 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NlkO54949 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NlkO54949 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NlkO54949 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NlkO54949 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NlkO54949 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NlkO54949 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NlkO54949 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NlkO54949 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NlkO54949 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NlkO54949 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NlkO54949 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NlkO54949 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NlkO54949 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NlkO54949 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NlkO54949 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NlkO54949 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NlkO54949 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NlkO54949 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NlkO54949 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NlkO54949 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NlkO54949 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NlkO54949 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NlkO54949 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NlkO54949 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NlkO54949 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NlkO54949 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NlkO54949 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NlkO54949 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NlkO54949 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NlkO54949 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NlkO54949 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NlkO54949 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NlkO54949 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NlkO54949 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NlkO54949 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NlkO54949 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NlkO54949 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NlkO54949 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NlkO54949 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NlkO54949 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NlkO54949 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NlkO54949 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NlkO54949 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NlkO54949 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NlkO54949 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NlkO54949 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NlkO54949 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NlkO54949 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NlkO54949 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NlkO54949 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NlkO54949 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NlkO54949 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NlkO54949 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NlkO54949 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NlkO54949 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NlkO54949 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NlkO54949 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NlkO54949 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NlkO54949 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NlkO54949 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NlkO54949 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NlkO54949 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NlkO54949 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NlkO54949 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NlkO54949 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NlkO54949 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NlkO54949 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms