Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1i2O54915 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1i2O54915 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms