Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Per1O35973 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Per1O35973 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Per1O35973 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Per1O35973 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Per1O35973 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Per1O35973 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Per1O35973 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Per1O35973 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Per1O35973 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Per1O35973 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Per1O35973 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Per1O35973 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Per1O35973 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Per1O35973 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Per1O35973 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Per1O35973 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Per1O35973 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Per1O35973 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Per1O35973 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Per1O35973 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Per1O35973 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Per1O35973 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Per1O35973 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Per1O35973 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Per1O35973 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Per1O35973 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Per1O35973 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Per1O35973 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Per1O35973 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Per1O35973 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Per1O35973 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Per1O35973 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Per1O35973 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Per1O35973 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Per1O35973 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Per1O35973 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Per1O35973 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Per1O35973 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Per1O35973 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Per1O35973 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Per1O35973 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Per1O35973 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Per1O35973 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Per1O35973 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Per1O35973 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Per1O35973 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Per1O35973 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Per1O35973 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Per1O35973 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Per1O35973 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Per1O35973 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Per1O35973 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Per1O35973 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Per1O35973 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Per1O35973 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Per1O35973 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Per1O35973 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Per1O35973 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Per1O35973 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Per1O35973 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Per1O35973 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Per1O35973 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Per1O35973 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Per1O35973 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Per1O35973 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Per1O35973 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Per1O35973 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Per1O35973 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Per1O35973 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Per1O35973 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Per1O35973 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Per1O35973 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Per1O35973 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Per1O35973 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Per1O35973 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Per1O35973 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Per1O35973 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Per1O35973 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Per1O35973 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Per1O35973 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Per1O35973 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Per1O35973 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Per1O35973 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Per1O35973 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Per1O35973 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Per1O35973 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Per1O35973 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Per1O35973 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Per1O35973 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Per1O35973 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Per1O35973 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Per1O35973 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Per1O35973 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Per1O35973 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Per1O35973 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Per1O35973 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Per1O35973 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Per1O35973 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Per1O35973 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms