Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek2O35942 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek2O35942 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek2O35942 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nek2O35942 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek2O35942 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek2O35942 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek2O35942 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nek2O35942 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek2O35942 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek2O35942 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek2O35942 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek2O35942 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek2O35942 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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