Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp100O35892 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp100O35892 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp100O35892 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp100O35892 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp100O35892 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp100O35892 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp100O35892 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp100O35892 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp100O35892 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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