Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pold2O35654 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pold2O35654 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pold2O35654 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pold2O35654 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pold2O35654 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold2O35654 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold2O35654 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold2O35654 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold2O35654 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold2O35654 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms