Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eftud2O08810 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eftud2O08810 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms