Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkcshO08795 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrkcshO08795 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkcshO08795 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms