Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp12O08736 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp12O08736 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp12O08736 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp12O08736 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casp12O08736 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp12O08736 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casp12O08736 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp12O08736 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp12O08736 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp12O08736 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp12O08736 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp12O08736 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casp12O08736 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp12O08736 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms