Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Barx2O08686 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Barx2O08686 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Barx2O08686 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Barx2O08686 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Barx2O08686 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Barx2O08686 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Barx2O08686 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Barx2O08686 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Barx2O08686 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Barx2O08686 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Barx2O08686 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Barx2O08686 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms