Protein–RNA interactions for Protein: L7N2B9

Gm3164, Predicted gene 3164, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3164L7N2B9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3164L7N2B9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3164L7N2B9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3164L7N2B9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms