Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20834J3QM72 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20834J3QM72 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20834J3QM72 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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