Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tubgcp6G5E8P0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tubgcp6G5E8P0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubgcp6G5E8P0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms