Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sclt1G5E861 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sclt1G5E861 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sclt1G5E861 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms